Ординатура по акушерству и гинекологии включает теоретический и практический блоки.
Особенностями теоретической подготовки является междисциплинарный характер преподаваемых предметов, а также большое значение самоподготовки в освоении теоретических дисциплин. Ординаторы учатся работе с современной литературой, анализу поступающей медицинской информации, а также сопоставлению полученных теоретических знаний и практического опыта.
Практическое обучение проходит на нескольких клинических базах: в родильном доме Городской клинической больницы № 1, где концентрируется самый сложный контингент беременных с экстрагенитальной патологией, предлежанием и врастанием плаценты; Городском Онкодиспансере, Городской клинической больнице № 11, в Клинике Пасман. На этих базах под руководством ведущих специалистов Новосибирска ординаторы имеют возможность ознакомиться и освоить новые методы диагностики, консервативного и хирургического лечения многих гинекологических заболеваний и акушерской патологии.
Результатом освоения теории и практики является выполнение клинической исследовательской работы, в которой ординатор проводит анализ полученного клинического опыта и его осмысление с позиций практикующего врача.