Ординатура по терапии включает теоретический и практический блоки.
Особенностями теоретической подготовки является междисциплинарный характер преподаваемых предметов, а также большое значение самоподготовки в освоении теоретических дисциплин. Ординаторы учатся работе с современной литературой, анализу поступающей медицинской информации, а также сопоставлению полученных теоретических знаний и практического опыта.
Практическое обучение по терапии клинических ординаторов проходит на базе Центральной клинической больницы, Больницы скорой медицинской помощи № 2. Ординаторы получают практические навыки в области терапии, кардиологии, пульмонологии, гастроэнтерологии, нефрологии, эндокринологии, поликлинической терапии, Городской поликлиники № 14. Ординаторы принимают участие в общих обхода и клинических разборах в Центральной клинической больнице, Международном томографическом центре, Клинике крови и Клинике Пасман.
Ординаторы работают последовательно в различных терапевтических отделениях, приемном отделении, дежурят, посещают патологоанатомические вскрытия. Результатом освоения теории и практики является выполнение клинической исследовательской работы, в которой ординатор проводит анализ полученного клинического опыта и его осмысление с позиций практикующего врача.